投资日本大致有以下几种方式
优点
驻在员办事处
1. 设立和关闭一般无需特别登记。
2. 经费可以从本国总公司的所得中予以扣除，所以在本国有节税效果。
支店（分公司）
1. 不需要资本金（※但需要提供运营资金。如本国是有外汇管制的话，实务操作上会比较困难，需注意）。
2. 分公司的亏损可以计入总公司，总公司和分公司的共同费用可以计入分公司的成本，具有跨境节税的功能。
現地法人
1. 在日本国内的信用度较高，方便业务开展（特别是以日本企业为对象的情况），也相对有利于申请金融机构的贷款或助成金等。
2. 代表高层可以申请投资签证。
3. 作为独立法人，其负债不会涉及到本国母公司。
4. 作为独立法人，发生诉讼纠纷时，不会波及到本国母公司。
缺点
驻在员办事处
1. 无法在日本开展经营活动，只可以作市场调查、信息收集、广告宣传等准备性、辅助性工作。
2. 在日本发生诉讼纠纷时，由于驻在员办事处是属于外国法人，因此本国总公司为当事方。
支店（分公司）
1. 设立和清算时所需的时间等与法人相差不多
2. 信用度较低，不利于经营活动的开展，且申请贷款困难。
3. 总公司需要对分公司的债务承担责任。
4. 无法从事某些有注册资本门槛的业务。
5. 总公司的会计报告也要在日本进行税务申报。
6. 分公司的法人税按照总公司的资本金进行计算，纳税额可能会随总公司规模增加而增加
7. 由于要与本国的所得合算，这方面的会计核算处理需要时间和人力。
8. 本国税务局的调查权可以直接涉及到日本分公司。
9. 发生诉讼纠纷时，会涉及到本国总公司。
日本法人（子公司）
1. 设立和清算的手续较复杂。
2. 作为独立法人，需要在日本进行独立核算，在没有特别的节税规划的情况下，其亏损和费用不能计入本国母公司进行合算，无跨境节税的功能。
3. 日本法人的利润汇出，将被视为分红。
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